indexファイルがないとディレクトリが丸見えになってしまう

http://www.itmedia.co.jp/help/tips/linux/l0272.html などを参考にWebサーバーの設定を修正してください。
設定変更できない場合は、フォルダの中にダミーのindex.htmlファイルなどを置いてください。